Já no segundo alerta, divulgada em abril, a instituição precedente essa previsão para aproximadamente 28,51 metros. Na ocasião, o Serviço Geológico do Brasil previu que o rio atingiria a cota de inundação, ou seja, que ultrapassaria os 27,50 metros. A probabilidade disso acontecer era de 99,14%, e ocorreu no dia 11 de maio, quando o Rio Negro 27,54 metros.